电子杂志通常以如下两种方式发行。一种是由印刷版杂志发行商自行发行。这种发行商通常是较大的或发展较快的发行商。它们直接通过Internet发行其杂志的电子版，不需要任何中介。发行商对电子杂志从内容到版面都具有完全的控制权。
另一种发行方式是通过中介服务机构,或称代理商发行。更多的发行商选择这种省心省力的发行方式。提供这种服务的代理商将许多来自不同发行商的刊物整合到统一的界面和检索系统中。它们往往在电子版面的设计，技术的更新和应用上有着很大的主动性和优势。用户通常也直接向代理商申请订阅并获得电子杂志的使用权。
价格

怎样为电子杂志定价一直是出版商和用户同时面对的一个棘手的问题。由于发行方式的巨大变化，电子杂志不但没有一个象印刷版一样成熟而且相对标准化的定价体系，而且因为其与计算机技术、网络和通讯技术的密切联系，电子杂志的定价还不免受到许多不断变化的外来因素的制约。出版商在探索市场、发展电子杂志用户的同时，又担心电子杂志对印刷版发行量的影响。因此，大多数出版商出于保护其自身利益的考虑，通常将杂志的电子版与印刷版捆绑在一起发行。用户，尤其是图书馆用户必须首先订购印刷版，然后才能以优惠的价格获得电子版的使用权。对于图书馆和个人订户而言，这种收费方式往往令人难以接受。
用户使用

电子杂志与印刷版的一个显著的不同在于必须致力于对订户的杂志使用权或可获得权（accessibility）的保障。怎样在Internet上为合法的订户提供有保障的杂志使用权/可获得权，同时又将不合法的网上访问者挡在外面，是一个与网络技术的发展应用密切相关的问题。在选择适当的实现方法时，必须权衡利弊，两者兼顾。大部分出版商往往选择这样一种方式：允许网上来访者浏览其杂志电子版的部分内容，比如样板文章、目次报道或者对于杂志的介绍等。而对于完全的内容，如文章的全文，则需要订户提供有效的身份认证。身份认证的两种常见的方式是：向订户分发口令（称Sever-based passwording）或者利用Internet的网址和域名限制访问者（称IP filtering）。前一种方式是将主动权交给订户，订户无论在何时何地，只要能够上网，都可以通过提交口令浏览杂志。这种方式对于个人订户比较方便，也便于管理。后一种方式是将订户的使用权根据网络E或域名的分配而局限在某个范围之内，比如个人计算机的某个网址，某个图书馆的所有网址或者某个系的所有网址，甚至整个学校的所有网址。这种方式对于多用户的情况更加适用。
编辑版面

电子版面的编辑方法是电子杂志区别于印刷版的最重要的特点，也是电子杂志与计算机网络技术关联最大，受其影响最深之处。它的意义已经远远超过了版面本身，而涉及到内容的多种表现方式，链接的选择和建立以及向读者提供的各种服务等等方面，成为杂志的灵魂。80年代末，电子杂志（如PACS Review）通常以ASCII格式排版，并通过Email发行。几年之后,电子杂志则以众多不同的电子格式排版，并通过WWW发行。对于读者而言，电子杂志的质量和发行方式都有了很大程度的提高和改善。而对于编辑和发行商而言，日新月异的工具所带来的不仅仅是排版上的可创造性和灵活性，而且还有许多印刷版不可能想象的可塑性和巨大潜力。电子杂志在版面编辑上令人瞩目的特色是由如下几个因素所决定的。
(1）电子文档数据库
电子杂志的核心是一个电子文档数据库。数据库中的电子文档携带着各种标识，使得文档可以被很方便地从数据库中检中并提取出来，然后按照不同的要求以各种各样的方式“再生”显示。相形之下，印刷版的核心则是一个个“千篇一律”的复本，一旦印刷完毕，装订成册，很难改变其既定的面貌。从存储方式的角度来说，传统的印刷版杂志被保存在世界各地，在个人的书橱或图书馆的书架上，承受着因岁月流逝和反复使用所造成的损伤。而电子杂志的数据库分布在有限的一个或者几个地方，通过网络供订户使用。不同的读者可以选择不同的显示方式，杂志编辑还可以根据需要对文档进行不断的修改和更新。数据库的日常更新和维护以及电子文档的处理是电子杂志发行中非常重要的一个环节。
(2）电子排版格式的多种选择
如上所述，电子杂志与印刷版杂志的一个不同在于它可以有不只一种显示方式。电子杂志在版面上的尝岗匾常期望迁就人们阅读印刷杂志的习惯。PDF格式、PostScript格式、早期使用的ASCII格式，用于显示、下载和打印数学符号的TeX和DVI格式以及扫描生成的图像如GIF或JEPG格式等都试图以与印刷版完全一致或者相似的形式来显示和打印文章。文章中包含复杂的数学公式和符号、特殊的字符和图像的杂志更是倾向于利用这些格式。其中Adobe Acrobat的PDF格式曾经，风靡一时。它的一个优点在于，读者不仅可以像浏览印刷版杂志一样一页一页地“翻阅”电子杂志，而且可以打印出与印刷版版面完全一样的文章，以便装订成与印刷版完全一样的一册杂志来。在1997年，PDF是出版商及有关电子出版项目将传统印刷版向电子版转换的首选格式。然而，PDF的缺点也是显而易见的。首先，PDF格式文件通常较大，下载耗时较长。其次，与印刷版相同的页面元法在计算机的一屏中完整地显示，读者必须上下翻屏，或者选择较小的比例显示,无论哪种选择都不尽如人意。另外，PDF格式最明显的缺陷还在于，它不提供超文本链接，以供读者在文章间自由地“航行',(navigating）。因此，与下面将要提到的支持超文本链接的HTML格式相比，PDF格式还远远不能体现出电子杂志的真正的风格。PDF格式的实际用途通常是作为读者打印他希望以纸张为介质来保存的那些文章的一种工具。
(3）超文本链接的应用
电子杂志的编辑风格与我们熟悉的印刷版的风格迥然不同。传统的印刷版杂志采用线性的表现方式。一本书或一篇文章从开始到结束，按页码排序L一目了然。而电子杂志的最佳表现方式是非线性的。这种非线性的表现方式由超文本链接来实现。电子版面通常由一个个简短而紧凑的小“模块"组成，这些模块的内容一般可以用一到两屏显示，符合人们浏览、阅读的习惯。更重要的是，模块之间以超文本链接作为联系，允许向前、向后或者跳跃式的转换。从文件类型来说，这种超文本链接不仅仅局限于文本之间的链接，还可以链接其它类型的相关资料，如图像、声像、三维动画等多媒体对象。从内容上来说，超文本链接可以被应用到对文章所涉及到的其它相关资源的链接，如对传统的索引/摘要数据库的链接，由文章脚注到相关出版物的链接，以及对一篇文章发表后，其它引用了该文的文章的链接(Foreword Referencing）等等。超文本链接的各种应用，使得电子杂志所能提供的信息量远远地超出了一篇文章和一本杂志的局限。而不同的杂志对于超文本链接丰富多彩的创造性的应用，也使得每一种电子杂志都拥有其独特的风格。这是传统的印刷版杂志所无法比拟的。基于这些原因，更多的电子杂志直接选择可以同时支持文本、图像和其它链接的HTML文件。其中还有一些出版商和电子版项目通过同时提供支持链接的HTML文件和方便打印的图像文件如PDF文件，而谋求鱼与熊掌兼而得之。
维护保存

从技术上说，电子杂志的长期维护是其区别于印刷版的一个重要方向。印刷版杂志一经.发行即无法进行任何修改，发行商也就失去了对杂志的控制权。而电子杂志所采取的网上发行方式、数据库的设计特点以及文件格式的选择却允许它在发行后还可以对其内容进行不断的更新和改进。这种更新的巧妙应用使电子杂志可以具有许多印刷版无法实现的新特征。比如前面所提到的“回溯索引”（Foreword  Referencing），就是一种在杂志发行、文章发表后对引用该文章的文章所做的索引。这些新的应用在为电子杂志增色的同时，也带来一系列悬而未决的问题。

谁应该长期维护过刊，承担并履行为读者提供服务的责任呢?是图书馆还是发行商?从技术支持和方便的角度考虑，出版商或者代理商顺理成章地应该也能够承担起过刊的长期维护和提供的责任。然而，必须考虑到的是，一旦出版商或代理商因各种原因而停业或者兼并，它曾经出版的电子杂志还能否继续在线以供读者阅览呢?从图书馆的角度而言，它的一个重要的传统功能是为读者（包括网上读者）提供杂志的过刊。但是，电子杂志的长期保存要比印刷版的保存更加复杂。它不但涉及到介质的自然消耗和损耗,还涉及到技术上经常性的更新和淘汰。由于计算机和网络技术日新月异的发展，我们可以预言，电子杂志所利用的技术会在不长的时间内就被淘汰出局。图书馆如果选择自行保存电子杂志的过刊的话，就必须在人力、物力和财力上不断地予以关注和投入，方可保证电子杂志过刊的长期可用。否则的话，服务器无法连接、HTML文档中链接过时或失效等等恼人的问题势必影响电子杂志的可检索性和可阅读性，也势必影响到电子杂志的声誉。因此，电子杂志过刊的保存、维护和向读者提供长期服务的问题是图书馆在订阅电子杂志时必须考虑的一个因素。而从另一个角度来看，电子杂志的长期维护和提供需要出版商和图书馆等各个方面的通力合作才能得到妥善的解决。
镜像

与电子杂志发行和长期保存相关的一个问题是当杂志在很大的范围内发行时，怎样有效地节省网络通讯资源。镜像是常见的选择。

镜像，就是在几个不同的地理位置设立镜像服务器，提供一种杂志的几个拷贝，供不同地理位置的读者使用。这样，读者可以使用本地的拷贝，少付或者不付网络通讯费用。首先，使用镜像的一个前提是，电子杂志不因时间或技术上的需要而更新，这恰恰与电子杂志的可更新性相矛盾。其次，电子杂志对于链接的应用也是维护镜像服务器的一个难点。电子杂志往往不但含有目次报道与文章全文之类的杂志内部的链接，还含有许多与杂志外部的链接，比如与其它电子杂志、索引/书目服务机构的数据库等等的链接。因此，电子杂志的维护实际上会牵涉到除了杂志本身以外的很多方面。另外，不同的镜像地点所使用的平台及其它应用软件的兼容，不同地理位置的时间差等也会给镜像带来问题。美国的TULIP电子杂志项目在开始实施时的一个设计思想就是在发行时向美国国内的九个图书馆分别提供拷贝，以便各个图书馆在本地向读者提供服务。这种方法在项目实施初期使用ASCII文件格式而不考虑杂志更新时是没有问题的。但到了后来，开始考虑使用以SGML为标准的HTML文件格式时，问题就暴露出来了。总之，通过网络向分散在各个地理位置的镜像提供并实时地维护、更新多个拷贝是一件非常复杂的工作。

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